引言本系列开启R中单细胞RNA-seq数据分析教程[1],持续更新,欢迎关注,转发!8. 细胞聚类分析 scRNA-seq 数据时,绘制标记基因的特征图通常是一个良好的起点。然而,要深入理解数据中的异质性,需要通过无偏的方式将细胞分组,这就是聚类的作用。理论上,任何聚类方法都可以应用于 scRNA-
引言R 是进行统计计算和数据分析的热门编程语言之一,广泛应用于数据科学家、研究者和统计学家之间,用于处理大数据、执行复杂分析和结果可视化。如果你是 R 的新手或希望提升你的 R 技能,这里有一些核心资源可以助你一臂之力,无论是从基础学起还是提高现有水平,包括官方站点、知名学府和互动式学习平台。1.
引言Docker 是一个广受欢迎的工具,它可以帮助我们创建、部署和维护容器化应用,但随着应用的扩展,容器、镜像和配置的管理可能会变得日益复杂。这里有一份关于一些关键 Docker 工具的详细指南[1],它们能够简化你的工作流程,无论你是 Docker 新手还是资深用户。这些工具能够助你更高效地监控、
引言探索机器如何识别人名、地点和物体 —— 并学习如何打造你自己的命名实体识别(NER)应用程序!为什么NER如此出色想象一下:你正在阅读一篇关于“华盛顿”的文章。它可能指的是华盛顿州,也可能是华盛顿特区,或者是乔治·华盛顿本人。这很让人困惑,对吧?机器也有同感 —— 除非我们教会它们如何理解这一切
引言我经常遇到一些开发者,他们对Python的错误处理机制了如指掌,但当我查看他们的代码时,却发现代码质量远远不够。Python的异常处理就是这样一个领域,它有一个广为人知的表层,以及一个更深层次、几乎不为人知的层面,许多开发者甚至没有意识到它的存在。如果你想测试一下自己对这个话题的理解,试着回答以
引言命令行界面(CLI),也就是我们常说的Shell,是 Linux 操作系统中不可或缺的一部分,它让用户能够以强大的方式与系统进行交互。每个 Linux 用户都有一个默认的Shell,这个Shell决定了用户在与系统交互时使用的命令解释器。有时候,我们可能需要更换用户的默认Shell,原因多种多样
引言本系列开启R中单细胞RNA-seq数据分析教程[1],持续更新,欢迎关注,转发!导入Seurat包首先,请确认你的R软件已经安装了Seurat这个包。library(Seurat)这会将您已安装的Seurat包载入您当前的R环境中。通常不会出现错误,但可能会有一些详细信息显示。如果提示您该包无
引言当远程甚至本地工作时,您通常可能需要从外部源获取内容。要获得此类内容,尤其是当您没有任何其他选择时,您将需要使用命令行工具来完成工作。在本文[1]中,将回顾一些最广泛使用的通过命令行下载内容的工具。Wget将介绍一款非常受欢迎的下载工具——wget。它能够通过 HTTP、HTTPS 和 FTP
引言本系列[1]将开展全新的转录组分析专栏,主要针对使用DESeq2时可能出现的问题和方法进行展开。Tximeta:自动导入并附加元数据Bioconductor 家族中的 tximeta 包,在 tximport 的基础上进行了扩展,不仅保留了原有功能,还增加了一项新特性:能够自动为常用的转录组数据
引言在 Python 编程语言中,闭包通常指的是一个嵌套函数,即在一个函数内部定义的另一个函数。这个嵌套的函数能够访问并保留其外部函数作用域中的变量。这种结构就构成了一个闭包。闭包在函数式编程语言中非常普遍。在 Python 中,闭包特别有用,因为它使得你可以创建基于函数的装饰器,这是一种非常强大的